Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smyd3Q9CWR2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smyd3Q9CWR2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms