Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Sycp2Q9CUU3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Sycp2Q9CUU3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Sycp2Q9CUU3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms