Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sppl3Q9CUS9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sppl3Q9CUS9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sppl3Q9CUS9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms