Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930553M12RikQ9CUH1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930553M12RikQ9CUH1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930553M12RikQ9CUH1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms