Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rhobtb3Q9CTN4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms