Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ska2Q9CR46 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ska2Q9CR46 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms