Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rdm1Q9CQK3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms