Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG9

Tmem100, Transmembrane protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem100Q9CQG9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem100Q9CQG9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmem100Q9CQG9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms