Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nipsnap3bQ9CQE1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms