Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ubl4bQ9CQ84 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ubl4bQ9CQ84 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ubl4bQ9CQ84 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ubl4bQ9CQ84 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ubl4bQ9CQ84 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms