Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpa3Q9CQ71 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpa3Q9CQ71 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rpa3Q9CQ71 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms