Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm2d1Q99MB3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d1Q99MB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms