Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PtprtQ99M80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprtQ99M80 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PtprtQ99M80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PtprtQ99M80 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PtprtQ99M80 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
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