Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lactb2Q99KR3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lactb2Q99KR3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lactb2Q99KR3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lactb2Q99KR3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lactb2Q99KR3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lactb2Q99KR3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms