Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ubxn2aQ99KJ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ubxn2aQ99KJ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms