Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ddb2Q99J79 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ddb2Q99J79 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms