Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PdgfdQ925I7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PdgfdQ925I7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PdgfdQ925I7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms