Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZF4

Ctsq, Cathepsin Q, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsqQ91ZF4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CtsqQ91ZF4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtsqQ91ZF4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CtsqQ91ZF4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtsqQ91ZF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms