Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q91WD4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q91WD4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q91WD4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q91WD4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q91WD4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q91WD4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q91WD4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q91WD4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q91WD4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q91WD4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q91WD4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q91WD4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q91WD4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q91WD4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q91WD4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q91WD4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q91WD4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q91WD4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q91WD4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q91WD4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q91WD4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q91WD4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q91WD4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q91WD4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q91WD4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q91WD4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q91WD4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q91WD4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q91WD4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q91WD4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q91WD4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q91WD4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q91WD4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q91WD4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q91WD4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q91WD4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q91WD4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q91WD4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q91WD4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q91WD4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q91WD4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms