Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx7Q8VDS3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cbx7Q8VDS3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cbx7Q8VDS3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms