Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CcsapQ8QZT2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CcsapQ8QZT2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CcsapQ8QZT2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 332.9 ms