Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ltbp4Q8K4G1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ltbp4Q8K4G1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms