Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Matr3Q8K310 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Matr3Q8K310 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms