Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Brd3Q8K2F0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Brd3Q8K2F0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.8 ms