Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Neil3Q8K203 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Neil3Q8K203 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms