Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbm17Q8JZX4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm17Q8JZX4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm17Q8JZX4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms