Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trip10Q8CJ53 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trip10Q8CJ53 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms