Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Setd1bQ8CFT2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Setd1bQ8CFT2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Setd1bQ8CFT2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms