Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nrip1Q8CBD1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nrip1Q8CBD1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nrip1Q8CBD1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms