Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc142Q8CAI1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc142Q8CAI1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc142Q8CAI1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms