Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Znf428Q8C1M2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf428Q8C1M2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf428Q8C1M2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms