Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc169Q8BXX9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc169Q8BXX9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc169Q8BXX9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms