Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV3

Gphn, Gephyrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GphnQ8BUV3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GphnQ8BUV3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GphnQ8BUV3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GphnQ8BUV3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms