Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dupd1Q8BK84 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dupd1Q8BK84 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dupd1Q8BK84 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dupd1Q8BK84 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms