Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc50Q810U5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc50Q810U5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms