Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc172Q810N9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc172Q810N9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc172Q810N9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms