Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zbed4Q80WQ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zbed4Q80WQ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zbed4Q80WQ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms