Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ell3Q80VR2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ell3Q80VR2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187 ms