Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc155Q80VJ8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc155Q80VJ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc155Q80VJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc155Q80VJ8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms