Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT79

Mcph1, Microcephalin, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcph1Q7TT79 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcph1Q7TT79 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcph1Q7TT79 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcph1Q7TT79 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms