Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snd1Q78PY7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snd1Q78PY7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snd1Q78PY7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms