Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Syne2Q6ZWQ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Syne2Q6ZWQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms