Protein–RNA interactions for Protein: Q6XVG2

Cyp2c54, Cytochrome P450 2C54, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c54Q6XVG2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c54Q6XVG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c54Q6XVG2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c54Q6XVG2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c54Q6XVG2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp2c54Q6XVG2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cyp2c54Q6XVG2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyp2c54Q6XVG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp2c54Q6XVG2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms