Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad54bQ6PFE3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rad54bQ6PFE3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms