Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mfsd13aQ6PDE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms