Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Edrf1Q6GQV7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Edrf1Q6GQV7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Edrf1Q6GQV7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms