Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl12Q62401 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl12Q62401 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms