Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim27Q62158 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim27Q62158 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim27Q62158 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms