Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
AtrxQ61687 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AtrxQ61687 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms