Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klf3Q60980 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms